MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 chromosome circular

Total Repeats: 107311

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010546	TCT	2	6	23	28	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034918
2	NC_010546	AAT	2	6	136	141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034918
3	NC_010546	TCC	2	6	253	258	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034918
4	NC_010546	GTT	2	6	285	290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034918
5	NC_010546	TCC	2	6	308	313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034918
6	NC_010546	TCT	2	6	368	373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034918
7	NC_010546	CCA	2	6	458	463	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034918
8	NC_010546	TCA	3	9	642	650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034918
9	NC_010546	AAT	2	6	747	752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034918
10	NC_010546	A	6	6	769	774	100 %	0 %	0 %	0 %	172034918
11	NC_010546	TTC	2	6	784	789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034918
12	NC_010546	AAT	2	6	790	795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034918
13	NC_010546	TCC	2	6	809	814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034918
14	NC_010546	AAAG	2	8	815	822	75 %	0 %	25 %	0 %	172034918
15	NC_010546	CGA	2	6	886	891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034918
16	NC_010546	GCT	2	6	934	939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
17	NC_010546	AGA	2	6	999	1004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034919
18	NC_010546	TTTG	2	8	1025	1032	0 %	75 %	25 %	0 %	172034919
19	NC_010546	A	6	6	1042	1047	100 %	0 %	0 %	0 %	172034919
20	NC_010546	TCT	2	6	1048	1053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034919
21	NC_010546	AAT	2	6	1221	1226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034919
22	NC_010546	C	6	6	1263	1268	0 %	0 %	0 %	100 %	172034919
23	NC_010546	GTC	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
24	NC_010546	TGA	2	6	1351	1356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034919
25	NC_010546	GCA	2	6	1384	1389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034919
26	NC_010546	TC	3	6	1412	1417	0 %	50 %	0 %	50 %	172034919
27	NC_010546	CA	3	6	1460	1465	50 %	0 %	0 %	50 %	172034919
28	NC_010546	CAAAA	2	10	1508	1517	80 %	0 %	0 %	20 %	172034919
29	NC_010546	CTG	2	6	1599	1604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
30	NC_010546	AAC	2	6	1616	1621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034919
31	NC_010546	TCC	2	6	1635	1640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034919
32	NC_010546	GTT	2	6	1820	1825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034919
33	NC_010546	GTC	2	6	1827	1832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
34	NC_010546	GCT	2	6	1876	1881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034919
35	NC_010546	TCGC	2	8	1892	1899	0 %	25 %	25 %	50 %	172034919
36	NC_010546	ATC	2	6	1900	1905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034919
37	NC_010546	TC	3	6	1927	1932	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_010546	CTG	2	6	2076	2081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034920
39	NC_010546	AG	3	6	2086	2091	50 %	0 %	50 %	0 %	172034920
40	NC_010546	CAA	2	6	2146	2151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034920
41	NC_010546	TCC	2	6	2222	2227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034920
42	NC_010546	ATTT	2	8	2315	2322	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_010546	CAA	2	6	2355	2360	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_010546	ATA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_010546	CAGA	2	8	2378	2385	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_010546	ACG	2	6	2412	2417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_010546	GTTT	2	8	2493	2500	0 %	75 %	25 %	0 %	172034921
48	NC_010546	T	6	6	2510	2515	0 %	100 %	0 %	0 %	172034921
49	NC_010546	TAAA	2	8	2607	2614	75 %	25 %	0 %	0 %	172034921
50	NC_010546	TTA	2	6	2789	2794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034921
51	NC_010546	TAA	2	6	2809	2814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
52	NC_010546	TAA	2	6	2844	2849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
53	NC_010546	CCA	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
54	NC_010546	ATG	2	6	2891	2896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034921
55	NC_010546	CTA	2	6	2910	2915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
56	NC_010546	TAG	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034921
57	NC_010546	GAA	2	6	2971	2976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034921
58	NC_010546	ATA	2	6	2990	2995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
59	NC_010546	ATT	2	6	3025	3030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034921
60	NC_010546	CCA	2	6	3126	3131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
61	NC_010546	CCATA	2	10	3213	3222	40 %	20 %	0 %	40 %	172034921
62	NC_010546	ATT	2	6	3301	3306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034921
63	NC_010546	ACCG	2	8	3325	3332	25 %	0 %	25 %	50 %	172034921
64	NC_010546	AATT	2	8	3340	3347	50 %	50 %	0 %	0 %	172034921
65	NC_010546	CCA	2	6	3396	3401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
66	NC_010546	GCT	2	6	3437	3442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034921
67	NC_010546	C	6	6	3646	3651	0 %	0 %	0 %	100 %	172034921
68	NC_010546	ACTC	2	8	3763	3770	25 %	25 %	0 %	50 %	172034921
69	NC_010546	GC	3	6	3792	3797	0 %	0 %	50 %	50 %	172034921
70	NC_010546	AGC	2	6	3991	3996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034921
71	NC_010546	AAT	2	6	4012	4017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
72	NC_010546	AACGA	2	10	4066	4075	60 %	0 %	20 %	20 %	172034921
73	NC_010546	AATG	2	8	4078	4085	50 %	25 %	25 %	0 %	172034921
74	NC_010546	TAA	2	6	4114	4119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
75	NC_010546	CA	3	6	4125	4130	50 %	0 %	0 %	50 %	172034921
76	NC_010546	CTA	2	6	4152	4157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
77	NC_010546	GCA	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034921
78	NC_010546	AATA	2	8	4178	4185	75 %	25 %	0 %	0 %	172034921
79	NC_010546	AAT	3	9	4255	4263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
80	NC_010546	A	6	6	4272	4277	100 %	0 %	0 %	0 %	172034921
81	NC_010546	GTT	2	6	4351	4356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034921
82	NC_010546	ATC	2	6	4396	4401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
83	NC_010546	CAC	2	6	4402	4407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
84	NC_010546	C	6	6	4429	4434	0 %	0 %	0 %	100 %	172034921
85	NC_010546	ATC	2	6	4520	4525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
86	NC_010546	TCA	2	6	4539	4544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
87	NC_010546	AAC	2	6	4550	4555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034921
88	NC_010546	GA	3	6	4588	4593	50 %	0 %	50 %	0 %	172034921
89	NC_010546	AGC	2	6	4612	4617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034921
90	NC_010546	CTG	2	6	4662	4667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034921
91	NC_010546	ATC	2	6	4748	4753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
92	NC_010546	ACC	2	6	4757	4762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034921
93	NC_010546	CTTTAA	2	12	4854	4865	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	172034921
94	NC_010546	TAA	2	6	4918	4923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034921
95	NC_010546	GCC	2	6	4930	4935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172034921
96	NC_010546	GCT	2	6	4979	4984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034921
97	NC_010546	GA	3	6	4999	5004	50 %	0 %	50 %	0 %	172034921
98	NC_010546	GA	3	6	5099	5104	50 %	0 %	50 %	0 %	172034921
99	NC_010546	GA	3	6	5149	5154	50 %	0 %	50 %	0 %	172034921
100	NC_010546	GA	3	6	5202	5207	50 %	0 %	50 %	0 %	172034921
101	NC_010546	TGT	2	6	5261	5266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034921
102	NC_010546	TAC	2	6	5320	5325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034921
103	NC_010546	GAG	2	6	5351	5356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034921
104	NC_010546	TCT	2	6	5429	5434	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034921
105	NC_010546	T	6	6	5585	5590	0 %	100 %	0 %	0 %	172034921
106	NC_010546	AAG	2	6	5602	5607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034921
107	NC_010546	C	6	6	5678	5683	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
108	NC_010546	C	6	6	5686	5691	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
109	NC_010546	G	6	6	5699	5704	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
110	NC_010546	CGT	2	6	5769	5774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_010546	CAT	2	6	5779	5784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_010546	ATTT	2	8	5795	5802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_010546	CCA	2	6	5830	5835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034922
114	NC_010546	CAC	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034922
115	NC_010546	AGC	2	6	5889	5894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034922
116	NC_010546	TCA	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
117	NC_010546	CTG	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034922
118	NC_010546	TCA	2	6	5996	6001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
119	NC_010546	CCG	2	6	6026	6031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172034922
120	NC_010546	GTT	2	6	6191	6196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034922
121	NC_010546	ATA	2	6	6271	6276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034922
122	NC_010546	ACC	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034922
123	NC_010546	TCA	2	6	6410	6415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
124	NC_010546	TCA	3	9	6428	6436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034922
125	NC_010546	GAA	2	6	6515	6520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_010546	A	6	6	6569	6574	100 %	0 %	0 %	0 %	172034923
127	NC_010546	GAG	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034923
128	NC_010546	CTT	2	6	6666	6671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034923
129	NC_010546	TAA	2	6	6697	6702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034923
130	NC_010546	TGA	3	9	6716	6724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
131	NC_010546	AT	3	6	6779	6784	50 %	50 %	0 %	0 %	172034923
132	NC_010546	GAT	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
133	NC_010546	TGT	2	6	6926	6931	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034923
134	NC_010546	ACC	2	6	6952	6957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034923
135	NC_010546	ATA	2	6	6967	6972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034923
136	NC_010546	ATG	2	6	7074	7079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034923
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260	NC_010546	T	6	6	12294	12299	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
261	NC_010546	ATT	2	6	12322	12327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034933
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269	NC_010546	ATCA	2	8	12966	12973	50 %	25 %	0 %	25 %	172034933
270	NC_010546	CAA	4	12	12977	12988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034933
271	NC_010546	CCT	2	6	13070	13075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034933
272	NC_010546	TAT	2	6	13155	13160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034933
273	NC_010546	ATC	2	6	13183	13188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034933
274	NC_010546	TTG	2	6	13207	13212	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034933
275	NC_010546	TAGT	2	8	13224	13231	25 %	50 %	25 %	0 %	172034933
276	NC_010546	GAA	2	6	13241	13246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034933
277	NC_010546	TGA	2	6	13297	13302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034933
278	NC_010546	TGG	2	6	13387	13392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034933
279	NC_010546	GTT	2	6	13397	13402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034933
280	NC_010546	AGA	2	6	13471	13476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034933
281	NC_010546	ATCGAA	2	12	13518	13529	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	172034933
282	NC_010546	GGA	2	6	13535	13540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034933
283	NC_010546	GGATTA	2	12	13544	13555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034933
284	NC_010546	CAT	3	9	13577	13585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034933
285	NC_010546	TAA	2	6	13714	13719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034934
286	NC_010546	TAA	2	6	13729	13734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034934
287	NC_010546	ATC	2	6	13768	13773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034934
288	NC_010546	CAT	2	6	13785	13790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034934
289	NC_010546	ATA	2	6	13824	13829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034934
290	NC_010546	AGCC	2	8	14004	14011	25 %	0 %	25 %	50 %	172034934
291	NC_010546	GATGAA	2	12	14022	14033	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	172034934
292	NC_010546	ACT	2	6	14053	14058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034934
293	NC_010546	AGAAA	2	10	14090	14099	80 %	0 %	20 %	0 %	172034934
294	NC_010546	AAG	2	6	14130	14135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034934
295	NC_010546	TCGGCA	2	12	14148	14159	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	172034934
296	NC_010546	ATA	2	6	14184	14189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034934
297	NC_010546	C	6	6	14213	14218	0 %	0 %	0 %	100 %	172034934
298	NC_010546	AAGA	2	8	14302	14309	75 %	0 %	25 %	0 %	172034934
299	NC_010546	GGGAAT	2	12	14311	14322	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	172034934
300	NC_010546	AAT	2	6	14367	14372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034934
301	NC_010546	TTTC	2	8	14460	14467	0 %	75 %	0 %	25 %	172034934
302	NC_010546	CAA	2	6	14493	14498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034934
303	NC_010546	GTG	2	6	14501	14506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034934
304	NC_010546	TAT	2	6	14571	14576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034934
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311	NC_010546	TCT	2	6	15017	15022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034934
312	NC_010546	CCG	2	6	15054	15059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	172034934
313	NC_010546	CAT	3	9	15061	15069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034934
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337	NC_010546	T	6	6	16060	16065	0 %	100 %	0 %	0 %	172034936
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349	NC_010546	T	9	9	16480	16488	0 %	100 %	0 %	0 %	172034937
350	NC_010546	T	6	6	16506	16511	0 %	100 %	0 %	0 %	172034937
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379	NC_010546	AGAA	2	8	17751	17758	75 %	0 %	25 %	0 %	172034937
380	NC_010546	ATT	2	6	17801	17806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
381	NC_010546	CT	3	6	17823	17828	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
382	NC_010546	ATA	2	6	17887	17892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_010546	ATT	2	6	17937	17942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
384	NC_010546	CAC	2	6	17958	17963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
385	NC_010546	AAC	2	6	18048	18053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034938
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390	NC_010546	ATC	2	6	18185	18190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034938
391	NC_010546	TCT	2	6	18205	18210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034938
392	NC_010546	GGT	2	6	18257	18262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034938
393	NC_010546	AAT	2	6	18348	18353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_010546	CTG	2	6	18417	18422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034939
395	NC_010546	CAAA	2	8	18493	18500	75 %	0 %	0 %	25 %	172034939
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397	NC_010546	A	7	7	18596	18602	100 %	0 %	0 %	0 %	172034939
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399	NC_010546	TTAGCT	2	12	18644	18655	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	172034939
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